公司自然人股东与法人股东在股东含义、股东性质、股东主体资格、税务方面都有所区别，主从3个方面区分：
（一）性质上的区别
1、公司的法人股东性质是一个组织或单位。股东在行使权力义务的时候是通过具体人的行为来进行，行使方式是法人单位派出股东代表，根据授权委托手续代表法人股东完成，后果由法人股东承担。
2、注册公司的自然人股东性质是—个具体的人。个人享有股东权利，并承担股东义务。
因此，性质区别上主要在于权利义务行使承担方式上有区别，权利义务的实质内容无区别，都享有知情权、收益权、优先受让和认购新股权、选择、监督管理者权。
（二）税务上的区别
1、取得公司分红。公司分红后，自然人股东应按20%的税率，计算缴纳个人所得税；法人股东可以根据企业所得税法的规定，将公司分红作为免税收入，免征企业所得税。
2、转让公司股权。股权转让时自然人股东应按“20%的税率，计算缴纳个人所得税；法人股东需按25%的税率，以公司转让股权卖出价减去买入价的差额进行计算并缴纳企业所得税。
 因此，从税务上来看，以法人股东的方式进行投资，对法人股东来说税负相对比较轻。
（三）法律上的区别
在违反规定，出现需要股东承担连带责任的情况下，承担的责任区别很大。
1、自然人股东存在着无限连带责任，会有导致自然人投资的个人财产出现“破产”的可能；
2、法人股东即使承担连带责任导致股东公司破产一般也不会追溯到投资者个人。

因此，在法律责任方面，使用法人身份作为股东进行投资，在投资经营过程中的法律风险要比以自然人身份作为股东小的多。

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